RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IER3P46695 156 aa0.05□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPY4RP50391 375 aa0.05□□□□□ -2.4
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAG2P55895 527 aa0.05□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CT45A2Q5DJT8 189 aa0.05□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM120AOSQ5T036 256 aa0.05□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEDAGQ5VYS4 303 aa0.05□□□□□ -2.4
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM252Q8N6L7 170 aa0.05□□□□□ -2.4
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STARD5Q9NSY2 213 aa0.04□□□□□ -2.4
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa0.04□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EHFQ9NZC4 300 aa0.04□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKMY1Q9P2S6 941 aa0.04□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa0.03□□□□□ -2.4
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