RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515062.5

SEC31A-240, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, human

TSL 3

Gene SEC31A, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEC31A-240	ENST00000515062	ATP5O	P48047	213 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	RAB35	Q15286	201 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	WBP1	Q96G27	269 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	LGMN	Q99538	433 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062		G3V2L1	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	MED7	O43513	233 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	TYROBP	O43914	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	AGT	P01019	485 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	HBQ1	P09105	142 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	GAL	P22466	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	MAGEA5	P43359	124 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	HAND2	P61296	217 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	SRPX	P78539	464 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF85	Q03923	595 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	TMEM187	Q14656	261 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062		Q6ZRP5	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PARL	Q9H300	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	POU2F1	P14859	743 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	SLC1A4	P43007	532 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	TMEM50B	P56557	158 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	GNB1	P62873	340 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PLD1	Q13393	1074 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	RCN1	Q15293	331 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PCK2	Q16822	640 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SEC31A-240	ENST00000515062	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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