RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	HHIP	Q96QV1	700 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549		A8MVJ9	347 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FLRT2	O43155	660 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TXNDC12	O95881	172 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC2A1	P11166	492 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD86	P42081	329 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCR9	P51686	369 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNAB1	Q14722	419 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4D1	Q15615	310 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GUCA2B	Q16661	112 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RGMB	Q6NW40	437 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	DPPA4	Q7L190	304 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUDT13	Q86X67	352 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM151A	Q8WW52	585 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RGMA	Q96B86	450 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MICU1	Q9BPX6	476 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRLF2	Q9HC73	371 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	C5	P01031	1676 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	YDJC	A8MPS7	323 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R143	59 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2F2	O95006	317 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARIH2	O95376	493 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CPN1	P15169	458 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXCL2	P19875	107 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPAM1	P38567	509 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTNR1A	P48039	350 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR15	P49685	360 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	AGTR2	P50052	363 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	BTN3A2	P78410	334 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	E2F1	Q01094	437 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2F1	Q13607	317 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	HNF4G	Q14541	408 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTPRR	Q15256	657 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACTBL2	Q562R1	376 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CPTP	Q5TA50	214 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	APOOL	Q6UXV4	268 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB24	Q969Q5	203 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXO17	Q96EF6	278 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATF6B	Q99941	703 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	INPP5K	Q9BT40	448 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEC11C	Q9BY50	192 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CBY3	A6NI87	242 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL22	O00626	93 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRRG1	O14668	218 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	AKR7A3	O95154	331 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RECK	O95980	971 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBC1	P01850	177 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	VTN	P04004	478 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDKN2D	P55273	166 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB40B	Q12829	278 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCARB2	Q14108	478 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SYTL3	Q4VX76	610 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	VPS25	Q9BRG1	176 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ALG8	Q9BVK2	526 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RDH14	Q9HBH5	336 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCTP	Q9UKL6	214 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHRNA4	P43681	627 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTNR1B	P49286	362 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAE1	Q13564	534 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBTPS1	Q14703	1052 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPRA1	Q86W33	373 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	C12orf42	Q96LP6	360 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		7.72	□□□□□ -1.17

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