RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 EFR3AQ14156 821 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CRB2Q5IJ48 1285 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 DCST2Q5T1A1 773 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PTOV1Q86YD1 416 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ULK2Q8IYT8 1036 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GALNT16Q8N428 558 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 OR5D16Q8NGK9 328 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SLC38A5Q8WUX1 472 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 DIO2Q92813 273 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CDS1Q92903 461 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SDF2Q99470 211 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 YIPF4Q9BSR8 244 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TRIM15Q9C019 465 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF350Q9GZX5 532 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ING2Q9H160 280 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GORASP2Q9H8Y8 452 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 IFT52Q9Y366 437 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CLEC18AA5D8T8 446 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 OR6C70A6NIJ9 312 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TMEM200CA6NKL6 621 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ENO4A6NNW6 628 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HS6ST1O60243 411 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SERPINB7O75635 380 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PPM1BO75688 479 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CIB2O75838 187 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PGM3O95394 542 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 BCHEP06276 602 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NGFRP08138 427 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ITGAMP11215 1152 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GGT1P19440 569 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ITGA3P26006 1051 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 IL12BP29460 328 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SSR4P51571 173 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CORO7P57737 925 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PLCXD2Q0VAA5 305 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 Q0VFX4 171 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GPAT3Q53EU6 434 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ABHD17BQ5VST6 288 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TCTN3Q6NUS6 607 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TMEM81Q6P7N7 255 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 BORAQ6PGQ7 559 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CLEC18BQ6UXF7 455 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NPSR1Q6W5P4 371 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NUP54Q7Z3B4 507 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 IFNEQ86WN2 208 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 EID3Q8N140 333 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 KIF2BQ8N4N8 673 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 BCORP1Q8N888 145 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF527Q8NB42 609 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CLEC18CQ8NCF0 446 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 DOK4Q8TEW6 326 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 RAB8BQ92930 207 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TMCO6Q96DC7 493 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TMEM19Q96HH6 336 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 LMF1Q96S06 567 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 MESP1Q9BRJ9 268 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 RNF32Q9H0A6 362 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ARMC7Q9H6L4 198 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF232Q9UNY5 417 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 DTX4Q9Y2E6 619 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 WDR45Q9Y484 360 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SNX13Q9Y5W8 968 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 DSPPQ9NZW4 1301 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ERICH4A6NGS2 130 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ARGFXA6NJG6 315 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CXCR6O00574 342 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TP53I11O14683 189 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN2O60636 221 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ITGA10O75578 1167 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CEACAM4O75871 244 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 H6PDO95479 791 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NADKO95544 446 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ALPPP05187 535 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 FBXO45P0C2W1 286 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PRKAR1AP10644 381 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NQO1P15559 274 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ABCD3P28288 659 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 KDELR2P33947 212 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SOX11P35716 441 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CASRP41180 1078 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CLK3P49761 638 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 POLE2P56282 527 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 FOXK1P85037 733 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 KCNAB2Q13303 367 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ACER2Q5QJU3 275 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms