RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 UTS2O95399 124 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 GP1BBP13224 206 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 DPY19L1Q2PZI1 675 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CDC73Q6P1J9 531 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 FIGNL1Q6PIW4 674 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD46Q86W74 232 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 EID3Q8N140 333 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CLEC4FQ8N1N0 589 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 MARVELD2Q8N4S9 558 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 STACQ99469 402 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ACTRT3Q9BYD9 372 aa19.09■□□□□ 0.65
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ACTB-211ENST00000480301 FBXO34Q9NWN3 711 aa19.09■□□□□ 0.65
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ACTB-211ENST00000480301 C9JVG2 144 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 SCO2O43819 266 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 DIAPH2O60879 1101 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
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ACTB-211ENST00000480301 S100A3P33764 101 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 SOAT1P35610 550 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP19.08■□□□□ 0.641e-17■■□□□ 12.5
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ACTB-211ENST00000480301 RPTNQ6XPR3 784 aa19.08■□□□□ 0.64
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ACTB-211ENST00000480301 MRGPRGQ86SM5 289 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 GALNT10Q86SR1 603 aa19.08■□□□□ 0.64
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ACTB-211ENST00000480301 COX18Q8N8Q8 333 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 OR4A15Q8NGL6 344 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 JADE3Q92613 823 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 CDS1Q92903 461 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 MARK4Q96L34 752 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 BTBD2Q9BX70 525 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A5Q9Y345 797 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 KCNE3Q9Y6H6 103 aa19.08■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 UBDO15205 165 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 TGDSO95455 350 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 IDO1P14902 403 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 DGKQP52824 942 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 TOMM20Q15388 145 aa19.07■□□□□ 0.64
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF585AQ6P3V2 769 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 C6orf120Q7Z4R8 191 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 MARCH3Q86UD3 253 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
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ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS15Q8TE58 950 aa19.07■□□□□ 0.64
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ACTB-211ENST00000480301 MAGEB18Q96M61 343 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 OR2B2Q9GZK3 357 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 ACBD3Q9H3P7 528 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGB4Q9UN71 923 aa19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 KRT16P08779 473 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 ACVR2AP27037 513 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 SRD5A2P31213 254 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 GSTA3Q16772 222 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 CCNJQ5T5M9 372 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 WLSQ5T9L3 541 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 VASNQ6EMK4 673 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 RTL6Q6ICC9 239 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 BHLHB9Q6PI77 547 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 FADS6Q8N9I5 356 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
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ACTB-211ENST00000480301 CCDC115Q96NT0 180 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 OR7D2Q96RA2 312 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 TIMP4Q99727 224 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 SERHL2Q9H4I8 314 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 SDHAF3Q9NRP4 125 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 BTNL2Q9UIR0 455 aa19.06■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 SOX30O94993 753 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 PGRP06401 933 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 BMP7P18075 431 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 AGAP20933 346 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 UQCRC2P22695 453 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 LCN1P31025 176 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 CLK3P49761 638 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 IDH3AP50213 366 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 SMSP52788 366 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa19.05■□□□□ 0.64
ACTB-211ENST00000480301 TMEM211Q6ICI0 200 aa19.05■□□□□ 0.64
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