RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 ARSIQ5FYB1 569 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 FDX2Q6P4F2 183 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SSX7Q7RTT5 188 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CACUL1Q86Y37 369 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 C1QL4Q86Z23 238 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GJD3Q8N144 294 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM163Q8TC26 289 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ACTL9Q8TC94 416 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TAAR9Q96RI9 348 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 DDA1Q9BW61 102 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TEX101Q9BY14 249 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PRO1933Q9H354 126 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 XKRY2A2RUG3 117 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GSAPA4D1B5 854 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 K7EP13 123 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SYT5O00445 386 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 NR5A2O00482 541 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNAB3O43448 404 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TGOLN2O43493 480 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF13O43567 381 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC19A2O60779 497 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TFP02787 698 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 NPIPA8P0DM63 369 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CXCL2P19875 107 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GABRR1P24046 479 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ITGB7P26010 798 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFS1P28331 727 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GDNFP39905 211 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CDKN2BP42772 138 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC1A2P43004 574 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TLE2Q04725 743 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR176Q14439 515 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC10A1Q14973 349 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MOB3CQ70IA8 216 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MIER2Q8N344 545 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF614Q8N883 585 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 C14orf79Q96F83 325 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TCTN2Q96GX1 697 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SHDQ96IW2 340 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PPM1MQ96MI6 270 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MGLLQ99685 303 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SMOQ99835 787 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SIK2Q9H0K1 926 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PDE7BQ9NP56 450 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 BARHL2Q9NY43 387 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 RASL12Q9NYN1 266 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 IRAK3Q9Y616 596 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 DOCK1Q14185 1865 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CBY3A6NI87 242 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DVL2O14641 736 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PMM2O15305 246 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SEMA7AO75326 666 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms