RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 PON3Q15166 354 aa20.35■□□□□ 0.85
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USP4-208ENST00000464168 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa20.35■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.35■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.35■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 H3BML4 177 aa20.34■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 COQ9O75208 318 aa20.34■□□□□ 0.85
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USP4-208ENST00000464168 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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USP4-208ENST00000464168 IMPDH1P20839 514 aa20.34■□□□□ 0.85
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USP4-208ENST00000464168 TIMM22Q9Y584 194 aa20.34■□□□□ 0.85
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USP4-208ENST00000464168 PCNX3Q9H6A9 2034 aa20.34■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 USF3Q68DE3 2245 aa20.33■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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USP4-208ENST00000464168 DECR1Q16698 335 aa20.33■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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USP4-208ENST00000464168 MARCH3Q86UD3 253 aa20.33■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.33■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 KCNA7Q96RP8 456 aa20.33■□□□□ 0.85
USP4-208ENST00000464168 TAS2R7Q9NYW3 318 aa20.33■□□□□ 0.85
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USP4-208ENST00000464168 IL33O95760 270 aa20.32■□□□□ 0.84
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USP4-208ENST00000464168 C2orf80Q0P641 193 aa20.32■□□□□ 0.84
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USP4-208ENST00000464168 TIFABQ6ZNK6 161 aa20.32■□□□□ 0.84
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USP4-208ENST00000464168 OR2L13Q8N349 312 aa20.32■□□□□ 0.84
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USP4-208ENST00000464168 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.32■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.32■□□□□ 0.84
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USP4-208ENST00000464168 ECHS1P30084 290 aa20.31■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 PKNOX1P55347 436 aa20.31■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.31■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 FAM71E1Q6IPT2 247 aa20.31■□□□□ 0.84
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USP4-208ENST00000464168 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20.31■□□□□ 0.84
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USP4-208ENST00000464168 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.31■□□□□ 0.84
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USP4-208ENST00000464168 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.3■□□□□ 0.84
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USP4-208ENST00000464168 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 ELP4Q96EB1 424 aa20.3■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 AMDHD1Q96NU7 426 aa20.3■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa20.3■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.3■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP4-208ENST00000464168 SONP18583 2426 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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