RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP1Q9NVV9 213 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ASIC5Q9NY37 505 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 MED11Q9P086 117 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ITPR2Q14571 2701 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 E9PLN8 166 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PRRG2O14669 202 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OIP5O43482 229 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SCO2O43819 266 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 HCN1O60741 890 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAPPC6AO75865 159 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TOXO94900 526 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNK2O95069 426 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX4O95219 450 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 UTS2O95399 124 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 IFI6P09912 130 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GLI4P10075 376 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PRF1P14222 555 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 BMP7P18075 431 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 LBPP18428 481 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPS1L1P21108 318 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPK1P28482 360 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 IL12BP29460 328 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 EVI2BP34910 448 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 HPCAL1P37235 193 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKN2CP42773 168 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RFX3P48380 749 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 MASP1P48740 699 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 STARP49675 285 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DGKQP52824 942 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN15P56746 228 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SNTA1Q13424 505 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SMU1Q2TAY7 513 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TBCELQ5QJ74 424 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OGFOD2Q6N063 350 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD46Q86W74 232 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 FADS6Q8N9I5 356 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2M3Q8NG83 312 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.37□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.37□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.37□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 DPY30Q9C005 99 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DSN1Q9H410 356 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ALG2Q9H553 416 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 AIG1Q9NVV5 245 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.37□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF6Q9Y252 685 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.37□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JNJ9 132 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR14I1A6ND48 311 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS44E7EML9 344 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 H0YC42 278 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 HDAC3O15379 428 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GMFGO60234 142 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SLITRK5O94991 958 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 HTR1EP28566 365 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 LHX2P50458 406 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GFRA1P56159 465 aa6.36□□□□□ -1.39
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