RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF21O75509 655 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CLK3P49761 638 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB113Q30KQ7 82 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 RAET1LQ5VY80 246 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 LIPMQ5VYY2 423 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CHMP1BQ7LBR1 199 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 MID2Q9UJV3 735 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 AKAP6Q13023 2319 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 SLC28A1O00337 649 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 SHBGP04278 402 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CPA3P15088 417 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 HK1P19367 917 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K8P41279 467 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN15P56746 228 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 PRR5P85299 388 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 KEAP1Q14145 624 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 P4HA3Q7Z4N8 544 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 STARD4Q96DR4 205 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 EGLN2Q96KS0 407 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CCT7Q99832 543 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 PIGQQ9BRB3 760 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 TRMOQ9BU70 441 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 RTN4RQ9BZR6 473 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 HHATLQ9HCP6 504 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 DLL4Q9NR61 685 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf109Q9NX04 203 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 FLRT3Q9NZU0 649 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 NDRG3Q9UGV2 375 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF175Q9Y473 711 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.94■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 MPDZO75970 2070 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 OR2M5A3KFT3 312 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 RGS14O43566 566 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 SEC22BO75396 215 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 KCNH1O95259 989 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 NEFHP12036 1026 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 FOSL1P15407 271 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 FRKP42685 505 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf67Q0P5P2 114 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 FGFBP1Q14512 234 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 RNF122Q9H9V4 155 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 LRTM1Q9HBL6 345 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 MED11Q9P086 117 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 NTMQ9P121 344 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF337Q9Y3M9 751 aa18.93■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 COPEO14579 308 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 PDPK1O15530 556 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 NKX2-2O95096 273 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 NGFRP08138 427 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 PRPS2P11908 318 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CPOXP36551 454 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM8P78325 824 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 STX5Q13190 355 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM44Q2T9K0 475 aa18.92■□□□□ 0.62
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LIMS1-208ENST00000428064 CLEC6AQ6EIG7 209 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 UBQLNLQ8IYU4 475 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 METTL25Q8N6Q8 603 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC63Q8NA47 563 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP28Q8NHY6 868 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP19Q8WTR2 217 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 MKS1Q9NXB0 559 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 TMED5Q9Y3A6 229 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 AP4B1Q9Y6B7 739 aa18.92■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 AZIN1O14977 448 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 EMC8O43402 210 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 UTS2O95399 124 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CD8BP10966 210 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 KRT4P19013 534 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 GABRA3P34903 492 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 SLC18A2Q05940 514 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 HSPB3Q12988 150 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 PDE7AQ13946 482 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 GUSBP1Q15486 140 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 VWA1Q6PCB0 445 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZSR9 355 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH3Q86UD3 253 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CDRT4Q8N9R6 151 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CEP70Q8NHQ1 597 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 61.5
LIMS1-208ENST00000428064 FIG4Q92562 907 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 REEP4Q9H6H4 257 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ELOVL5Q9NYP7 299 aa18.91■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPR1 153 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ALG1L2C9J202 215 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CASKO14936 926 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.62
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