RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCED1BQ96HM7 432 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C12orf66Q96MD2 445 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TGM7Q96PF1 710 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PANK2Q9BZ23 570 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STRADBQ9C0K7 418 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL25Q9H293 177 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RHOJQ9H4E5 214 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEK6Q9HC98 313 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRDM4Q9UKN5 801 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDH9Q9ULB4 789 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC7A7Q9UM01 511 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEDD4P46934 1319 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ACACBO00763 2458 aa3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EVPLQ92817 2033 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANHXE9PGG2 379 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LMO7DNF2Z398 122 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDUFS8O00217 210 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH2D1BO14796 132 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AKR7A2O43488 359 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSPAN2O60636 221 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CTSVO60911 334 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJB6O75190 326 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PMS2P2O95744 297 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGF1P05019 195 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IVLP07476 585 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RALBP11234 206 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF12P17014 697 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSPAN8P19075 237 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CA6P23280 308 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSMA2P25787 234 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UCP1P25874 307 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDST1P52848 882 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDH4P55283 916 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HERVK_113P63132 956 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERVK-8P63133 956 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZP4Q12836 540 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL18Q14116 193 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MANEAQ5SRI9 462 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LIPNQ5VXI9 398 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM225Q6GV28 225 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PAQR7Q86WK9 346 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KMT5CQ86Y97 462 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDK20Q8IZL9 346 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MLKLQ8NB16 471 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PELI1Q96FA3 418 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKRD27Q96NW4 1050 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UHRF2Q96PU4 802 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHP1Q99653 195 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PARD6BQ9BYG5 372 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 XKR8Q9H6D3 395 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR83Q9NYM4 423 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CA5BQ9Y2D0 317 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms