RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 SKP1P63208 163 aa5.91□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 CDC20Q12834 499 aa5.91□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP40-202ENST00000409945 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP40-202ENST00000409945 DEFB110Q30KQ9 67 aa5.89□□□□□ -1.47
USP40-202ENST00000409945 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.89□□□□□ -1.47
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USP40-202ENST00000409945 CDONQ4KMG0 1287 aa5.89□□□□□ -1.47
USP40-202ENST00000409945 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.89□□□□□ -1.47
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