RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 MCHR1Q99705 422 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC13-202ENST00000366662 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TTC13-202ENST00000366662 NUAK2Q9H093 628 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC13-202ENST00000366662 HRASLS2Q9NWW9 162 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC13-202ENST00000366662 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC13-202ENST00000366662 ASXL3Q9C0F0 2248 aa15.96■□□□□ 0.15
TTC13-202ENST00000366662 SGK494L7N484 410 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 FGF17O60258 216 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 KRT8P05787 483 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ERV3-1Q14264 604 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 NATD1Q8N6N6 113 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 AMER2Q8N7J2 671 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ART5Q96L15 291 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 TM9SF2Q99805 663 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ASPNQ9BXN1 380 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CD207Q9UJ71 328 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CLCA2Q9UQC9 943 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa15.96■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 AGAP5A6NIR3 686 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CCNKO75909 580 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 DDX5P17844 614 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 NT5EP21589 574 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 NNATQ16517 81 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 HSDL2Q6YN16 418 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 BARHL1Q9BZE3 327 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SP140LQ9H930 580 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 MED20Q9H944 212 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 WDR45Q9Y484 360 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 MUC3AQ02505 3323 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 A0A0G2JPF8 293 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CDC42EP2O14613 210 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ADAM15Q13444 863 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CEP78Q5JTW2 689 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 BHLHB9Q6PI77 547 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ZNF367Q7RTV3 350 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ZAR1Q86SH2 424 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 OR4K14Q8NGD5 310 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SLC7A7Q9UM01 511 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SH3D21A4FU49 640 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 GNB5O14775 395 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 MYL12BO14950 172 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ALX3O95076 343 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CT62P0C5K7 136 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 GABRG2P18507 467 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 LTBRP36941 435 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 HTR4Q13639 388 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 MFSD12Q6NUT3 480 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CDC73Q6P1J9 531 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SPERTQ8NA61 448 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CRELD1Q96HD1 420 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 BCL2L10Q9HD36 194 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 FAM60AQ9NP50 221 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 S100A5P33763 92 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 PPP5CP53041 499 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 C22orf42Q6IC83 251 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 TM9SF4Q92544 642 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 RSC1A1Q92681 617 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 TBX5Q99593 518 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 DAPP1Q9UN19 280 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC13-202ENST00000366662 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms