RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 DSCR3O14972 297 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 RFPL3O75679 317 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 TACSTD2P09758 323 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 CTSAP10619 480 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 TSPAN31Q12999 210 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 BEST4Q8NFU0 473 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 STK25O00506 426 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 CLDN4O14493 209 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 SOX30O94993 753 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ARFIP1P53367 373 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 PGGHGQ32M88 737 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ELOA3Q8NG57 546 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 CEP76Q8TAP6 659 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PP55 124 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ARSBP15848 533 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 OR8K3Q8NH51 312 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 CERS4Q9HA82 394 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 HHATLQ9HCP6 504 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 INSL6Q9Y581 213 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 SSX4O60224 188 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GKN3PP0CG01 181 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFS1P28331 727 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ACTC1P68032 377 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ACTA1P68133 377 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 FTMTQ8N4E7 242 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 OR51J1Q9H342 316 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 MCIDASD6RGH6 385 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 OCLNQ16625 522 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ASPGQ86U10 573 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 OR4K13Q8NH42 304 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 MS4A8Q9BY19 250 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 OR10A4Q9H209 315 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GPR34Q9UPC5 381 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 AHCYP23526 432 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GIFP27352 417 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB103AP81534 67 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ENPP2Q13822 863 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 NLRP8Q86W28 1048 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 RAB7BQ96AH8 199 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 OR7D2Q96RA2 312 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ABCG4Q9H172 646 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 OR52D1Q9H346 318 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 WASH3PC4AMC7 463 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 CLEC3AO75596 197 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 C1QCP02747 245 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 CHRNB1P11230 501 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 MMP12P39900 470 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ASAH1Q13510 395 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 NKD1Q969G9 470 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 NANSQ9NR45 359 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GYPBP06028 91 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GRPRP30550 384 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 GRK5P34947 590 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-201ENST00000345512 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms