RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 FAM227AF5H4B4 570 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NTRK1P04629 796 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FCER2P06734 321 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CKMT2P17540 419 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ACP1P24666 158 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MPIP34949 423 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GPC1P35052 558 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GCGRP47871 477 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CCR4P51679 360 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CAMK2DQ13557 499 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 COX20Q5RI15 118 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SAXO2Q658L1 398 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CPZQ66K79 652 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GLYATQ6IB77 296 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CLIP4Q8N3C7 705 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MARC2Q969Z3 335 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZNF681Q96N22 645 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ACTR6Q9GZN1 396 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ARGFXA6NJG6 315 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 AQP12BA6NM10 295 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 C12orf71A8MTZ7 269 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 A8MUA0 341 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 H3BNX3 289 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SCO1O75880 301 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 KCNK5O95279 499 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 BMI1P35226 326 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CRATP43155 626 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MVDP53602 400 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RAB15P59190 212 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RHDQ02161 417 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ATAD3BQ5T9A4 648 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SSX9Q7RTT3 188 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RNF130Q86XS8 419 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 AQP12AQ8IXF9 295 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TIGD4Q8IY51 512 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PRSS33Q8NF86 280 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RASSF5Q8WWW0 418 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FIG4Q92562 907 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NEURL3Q96EH8 262 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TIGARQ9NQ88 270 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NUP210LQ5VU65 1888 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 D6RAR5 112 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 H0YIG0 161 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CXCR6O00574 342 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GP1BAP07359 652 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 LYNP07948 512 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FHP07954 510 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RNH1P13489 461 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CD59P13987 128 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CD46P15529 392 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 XKP51811 444 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FOLH1Q04609 750 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TCF15Q12870 199 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ADRM1Q16186 407 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SYT16Q17RD7 645 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PTOV1Q86YD1 416 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.66□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.66□□□□□ -1.5
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