RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 LAMA1P25391 3075 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS20P59510 1910 aa16.61■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 AP3D1O14617 1153 aa16.61■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 SLC38A4Q969I6 547 aa16.61■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 GDF7Q7Z4P5 450 aa16.6■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 LINC00471Q8N535 108 aa16.6■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 COL6A3P12111 3177 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 RGS10O43665 173 aa16.6■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 IGKV1D-16P01601 117 aa16.6■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 AHCYL1O43865 530 aa16.58■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 GP2P55259 537 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 FUT7Q11130 342 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 TUBA3CQ13748 450 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 NR0B2Q15466 257 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 CD300LDQ6UXZ3 194 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.58■□□□□ 0.25
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