RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 ALPPP05187 535 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 LIFP15018 202 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAPK14Q16539 360 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 COMTD1Q86VU5 262 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 LILRA2Q8N149 483 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 LZICQ8WZA0 190 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMBIM1Q969X1 311 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 HSPBAP1Q96EW2 488 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 G6PC3Q9BUM1 346 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHID1Q9BWS9 393 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHST2Q9Y4C5 530 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 MED13Q9UHV7 2174 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 NPIPA7E9PJI5 369 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 MASP2O00187 686 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 TIPRLO75663 272 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 UGT2B17O75795 530 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 MT-ND1P03886 318 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 FESP07332 822 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 NPIPA8P0DM63 369 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPINK2P20155 84 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAGEA2P43356 314 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 RFX3P48380 749 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 Q0VFX4 171 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 DECR1Q16698 335 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 TBC1D25Q3MII6 688 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 IQCCQ4KMZ1 466 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 FKBP9P1Q75LS8 142 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 VRK2Q86Y07 508 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 RAB43Q86YS6 212 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PEX5LQ8IYB4 626 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR5L2Q8NGL0 311 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR52P1PQ8NH57 321 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 RASSF5Q8WWW0 418 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 C7orf34Q96L11 122 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 EFHD1Q9BUP0 239 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 SCNM1Q9BWG6 230 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PINK1Q9BXM7 581 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PEX12O00623 359 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 TSPAN2O60636 221 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 THBS1P07996 1170 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 TNFRSF1BP20333 461 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP6V1C1P21283 382 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCD3P28288 659 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PSPHP78330 225 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 IFI44LQ53G44 452 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRR22Q8IZ63 422 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC34A3Q8N130 599 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 DIO2Q92813 273 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PKP2Q99959 881 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYOTQ9UBF9 498 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 BAG5Q9UL15 447 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 IFT52Q9Y366 437 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 BAG2O95816 211 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 DBIP07108 87 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRKAR1BP31321 381 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 VLDLRP98155 873 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 CLN3Q13286 438 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP1A4Q13733 1029 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF141Q15928 474 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 VASH2Q86V25 355 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 OMA1Q96E52 524 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 VPS50Q96JG6 964 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 HEATR5AQ86XA9 2040 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 WWP2O00308 870 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 SYT5O00445 386 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 LGI1O95970 557 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ITGAMP11215 1152 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ICAM2P13598 275 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 DCTP40126 519 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR1E2P47887 323 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP12AP54707 1039 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms