RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 FADDQ13158 208 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 GPAT3Q53EU6 434 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 OR10A6Q8NH74 314 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 ZG16BQ96DA0 208 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 NSL1Q96IY1 281 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 PROK2Q9HC23 129 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 EML6Q6ZMW3 1958 aa20.38■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 C17orf51A8MQB3 221 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 TP53I11O14683 189 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 UBOX5O94941 541 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 UTS2O95399 124 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 H6PDO95479 791 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 TFPTP0C1Z6 253 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CASP3P42574 277 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 PSPHP78330 225 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 ADRM1Q16186 407 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 GRHL3Q8TE85 626 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SCMH1Q96GD3 660 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 C5orf34Q96MH7 638 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 RTN4RQ9BZR6 473 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 RUBCNLQ9H714 662 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SOX30O94993 753 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 AGR2O95994 175 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 BCHEP06276 602 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CHRM4P08173 479 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 NR2F1P10589 423 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 DNASE1L1P49184 302 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC25A3Q00325 362 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 GPR68Q15743 365 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 APOOLQ6UXV4 268 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 HPS6Q86YV9 775 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SULF2Q8IWU5 870 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 Q8NA96 180 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF350Q9GZX5 532 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 USP22Q9UPT9 525 aa20.37■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 PINLYPA6NC86 204 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CDK2AP1O14519 115 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC28A2O43868 658 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 NME2P1O60361 137 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 P04436 131 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 ATP6V1C1P21283 382 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 NME2P22392 152 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 RFC3P40938 356 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CHRNEQ04844 493 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 NFATC3Q12968 1075 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 EFR3AQ14156 821 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 OR8J3Q8NGG0 315 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 TMCO6Q96DC7 493 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 METTL7AQ9H8H3 244 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CMTM6Q9NX76 183 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 EXPH5Q8NEV8 1989 aa20.36■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 STX11O75558 287 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 BMP2P12643 396 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 EVI2BP34910 448 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 PMP22Q01453 160 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 BNIP1Q12981 228 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 TMEM19Q96HH6 336 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 KCNE5Q9UJ90 142 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 NINQ8N4C6 2090 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 HS6ST1O60243 411 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 PTGDSP41222 190 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC7A2P52569 658 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 CYP51A1Q16850 503 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 FRRS1Q6ZNA5 592 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 PTOV1Q86YD1 416 aa20.35■□□□□ 0.85
SOHLH1-201ENST00000298466 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms