RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 PLOD3O60568 738 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 GPX5O75715 221 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 THY1P04216 161 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 HBQ1P09105 142 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SOX6P35712 828 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 STAT5AP42229 794 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 HHEXQ03014 270 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 C11orf74Q86VG3 221 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SHISA5Q8N114 240 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 CDRT4Q8N9R6 151 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF576Q9H609 170 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 IRGMA1A4Y4 181 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 S100A5P33763 92 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 COL19A1Q14993 1142 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL22Q53GT1 634 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ARMC6Q6NXE6 501 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 PAQR6Q6TCH4 344 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 NRMQ8IXM6 262 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 COX18Q8N8Q8 333 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 MSANTD3Q96H12 275 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 GPR174Q9BXC1 333 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 NDUFB11Q9NX14 153 aa22.33■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 STX11O75558 287 aa22.33■■□□□ 1.16
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TRIM54-201ENST00000296098 GPR4P46093 362 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 BCAP31P51572 246 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM255BQ8WV15 326 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 OSTF1Q92882 214 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 STACQ99469 402 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 STARD5Q9NSY2 213 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 SEC14L4Q9UDX3 406 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 SLC7A7Q9UM01 511 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 GPR52Q9Y2T5 361 aa22.33■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 PIP5K1CO60331 668 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 DBIP07108 87 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF136P52737 540 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 C1orf61Q13536 156 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 PIK3R3Q92569 461 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 POMT2Q9UKY4 750 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 SCN2AQ99250 2005 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.32■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 KLF4O43474 513 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 IFI6P09912 130 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 TYRP1P17643 537 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 MYL12AP19105 171 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 RAB38P57729 211 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 RAB40BQ12829 278 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 RNFT2Q96EX2 444 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 PEX16Q9Y5Y5 336 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 SGK494L7N484 410 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 ETV5P41161 510 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 ETV1P50549 477 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 GAS1P54826 345 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF620Q6ZNG0 422 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 PARGQ86W56 976 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 GALNT12Q8IXK2 581 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 POGLUT1Q8NBL1 392 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 ANKK1Q8NFD2 765 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 TEX12Q9BXU0 123 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 SEMA6CQ9H3T2 930 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 STUB1Q9UNE7 303 aa22.31■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.3■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 B4DGG1 531 aa22.3■■□□□ 1.16
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TRIM54-201ENST00000296098 NID1P14543 1247 aa22.3■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 ST6GAL1P15907 406 aa22.3■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 PRKCDQ05655 676 aa22.3■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 MGAT2Q10469 447 aa22.3■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 MAPK14Q16539 360 aa22.3■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 DEFB110Q30KQ9 67 aa22.3■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 GPR151Q8TDV0 419 aa22.3■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 CNPPD1Q9BV87 410 aa22.3■■□□□ 1.16
TRIM54-201ENST00000296098 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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