RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DMAP28067 261 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PSMB5P28074 263 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GDI1P31150 447 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 LIM2P55344 173 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GPR19Q15760 415 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TCTN1Q2MV58 587 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TM9SF2Q99805 663 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 BLACEA4D250 179 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GABRPO00591 440 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 AXIN1O15169 862 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 YY2O15391 372 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 OR6A2O95222 327 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CISD3P0C7P0 127 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 EDNRAP25101 427 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TGFBR1P36897 503 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CCR2P41597 374 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SLC3A1Q07837 685 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TPBGQ13641 420 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MRI1Q9BV20 369 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 LGR4Q9BXB1 951 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 Q9N2J8 555 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 A0A0A6YYD5 115 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CPOQ8IVL8 374 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ZNF527Q8NB42 609 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 OR5W2Q8NH69 310 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GRHL3Q8TE85 626 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TMEM239Q8WW34 195 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MYLIPQ8WY64 445 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MYADMQ96S97 322 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 HHATLQ9HCP6 504 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 OR1A2Q9Y585 309 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 RNF13O43567 381 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CD6P30203 668 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PITPNBP48739 271 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF17Q02223 184 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MAP4K2Q12851 820 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GPNMBQ14956 572 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 RPE65Q16518 533 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 VRK2Q86Y07 508 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MSRAQ9UJ68 235 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 FBXO10Q9UK96 956 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 FAM227AF5H4B4 570 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 K7ESM1 405 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MAN2B1O00754 1011 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 DSCR3O14972 297 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SLC43A1O75387 559 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 APOL3O95236 402 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PAPLNO95428 1278 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 IFNA7P01567 189 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GALP22466 123 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 BLKP51451 505 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 OR2L3Q8NG85 312 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MMP28Q9H239 520 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 BRD7Q9NPI1 651 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TTC3P53804 2025 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 AGRPO00253 132 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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