RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262435.13

SMURF2-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2-201ENST00000262435 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 FGF11Q92914 225 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SNX18Q96RF0 628 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ATF6BQ99941 703 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 PELI2Q9HAT8 420 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 MARK1Q9P0L2 795 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ASGR2P07307 311 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CLUP10909 449 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 RNF170Q96K19 258 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 WDR26Q9H7D7 661 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ASB4Q9Y574 426 aa14.74□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 GABRA5P31644 462 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 GCGRP47871 477 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 OMPP47874 163 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SEC13P55735 322 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 TPBGQ13641 420 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 FGL2Q14314 439 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SLC35A4Q96G79 324 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 RNF32Q9H0A6 362 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 KLHL1Q9NR64 748 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 MAFFQ9ULX9 164 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 E9PI62 339 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SLC31A1O15431 190 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ELK1P19419 428 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 GALK2Q01415 458 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SLC3A1Q07837 685 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 EFR3AQ14156 821 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 TRAM2Q15035 370 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ARL9Q6T311 187 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 KRT74Q7RTS7 529 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 RDH10Q8IZV5 341 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 TMIEQ8NEW7 156 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 PFN4Q8NHR9 129 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 PIGXQ8TBF5 258 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CHFRQ96EP1 664 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 COX14Q96I36 57 aa14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CFAP54Q96N23 3096 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 A0A0B4J203 849 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 BTN3A3O00478 584 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 GNB5O14775 395 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 LYRM1O43325 122 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SPTBP11277 2137 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SHC1P29353 583 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 EVI2BP34910 448 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 DRD3P35462 400 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ACVR1BP36896 505 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 HCCSP53701 268 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 GPLD1P80108 840 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 IRF4Q15306 451 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CCDC58Q4VC31 144 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 TMEM99Q8N816 258 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF614Q8N883 585 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 ELP4Q96EB1 424 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 TOX2Q96NM4 488 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 LIPT1Q9Y234 373 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 RPN2P04844 631 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 SYPP08247 313 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 CPN2P22792 545 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 HTR2BP41595 481 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 VEGFBP49765 207 aa14.72□□□□□ -0.05
SMURF2-201ENST00000262435 RAB28P51157 221 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms