RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253122.9

SLC6A8-201, Transcript of solute carrier family 6 member 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC6A8, Length 3,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8-201ENST00000253122 LEFTY1O75610 366 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.021e-30■□□□□ 9.5
SLC6A8-201ENST00000253122 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 OPCMLQ14982 345 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 RGMAQ96B86 450 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 FAM25EA8MYX2 175 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 CHP2O43745 196 aa14.94□□□□□ -0.02
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SLC6A8-201ENST00000253122 CD79BP40259 229 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC6A11P48066 632 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 TPBGQ13641 420 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SYT9Q86SS6 491 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SCLYQ96I15 445 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 ATF6BQ99941 703 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.93□□□□□ -0.02
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SLC6A8-201ENST00000253122 CDK2AP1O14519 115 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 DPM1O60762 260 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 RP2O75695 350 aa14.93□□□□□ -0.02
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SLC6A8-201ENST00000253122 EPHA5P54756 1037 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 AANATQ16613 207 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.93□□□□□ -0.02
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SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 RNF170Q96K19 258 aa14.93□□□□□ -0.02
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SLC6A8-201ENST00000253122 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 PCDH8O95206 1070 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 ADRA2AP08913 450 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 OR10A3P58181 314 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 GJD3Q8N144 294 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SAMD11Q96NU1 681 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.93□□□□□ -0.02
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SLC6A8-201ENST00000253122 LGI1O95970 557 aa14.93□□□□□ -0.02
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SLC6A8-201ENST00000253122 ARHGDIBP52566 201 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 CRYBA2P53672 197 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 TNK1Q13470 666 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM107Q6UX40 140 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
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SLC6A8-201ENST00000253122 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 CD180Q99467 661 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 EMC7Q9NPA0 242 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM129A0AVI4 362 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 CD160O95971 181 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 GYPBP06028 91 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 ACP5P13686 325 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 CXCL3P19876 107 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 BTG1P62324 171 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 DSC1Q08554 894 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC9A5Q14940 896 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 C4orf46Q504U0 113 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 TCTE1Q5JU00 501 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 FBXL6Q8N531 539 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 ST8SIA4Q92187 359 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 UCN3Q969E3 161 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SFXN2Q96NB2 322 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 RCE1Q9Y256 329 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.92□□□□□ -0.02
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SLC6A8-201ENST00000253122 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 INPPL1O15357 1258 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 KLHL18O94889 574 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SPDEFO95238 335 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SEMG1P04279 462 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 EDNRAP25101 427 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 STK11Q15831 433 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC6A8-201ENST00000253122 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.92□□□□□ -0.02
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