RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 DENND1CQ8IV53 801 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 SKA3Q8IX90 412 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CPXM2Q8N436 756 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF527Q8NB42 609 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.93□□□□□ -1.46
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SGIP1-201ENST00000237247 RPA4Q13156 261 aa5.92□□□□□ -1.46
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SGIP1-201ENST00000237247 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
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SGIP1-201ENST00000237247 RNH1P13489 461 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 SDHAP31040 664 aa5.92□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CNR2P34972 360 aa5.92□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 NUDT6P53370 316 aa5.92□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CRISP3P54108 245 aa5.92□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 GAS1P54826 345 aa5.92□□□□□ -1.46
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