RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 RFX3P48380 749 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 C3AR1Q16581 482 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 C4orf17Q53FE4 359 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 C1QL3Q5VWW1 255 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 JADE3Q92613 823 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 VPS33AQ96AX1 596 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 WIF1Q9Y5W5 379 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 FAM234BA2RU67 622 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 WIPF3A6NGB9 483 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 CCDC154A6NI56 674 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 LRRTM2O43300 516 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 HPNP05981 417 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 CA7P43166 264 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 MASP1P48740 699 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 CASP9P55211 416 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 EMC4Q5J8M3 183 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 COX18Q8N8Q8 333 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 OR1J4Q8NGS1 313 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS15Q8TE58 950 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 NEURL3Q96EH8 262 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 MED12Q93074 2177 aa20.32■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SUSD5O60279 629 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 GSNP06396 782 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ATP4BP51164 291 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 RBPJQ06330 500 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.845e-12■□□□□ 8.6
SYF2-201ENST00000236273 OR5M10Q6IEU7 315 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 MARCH3Q86UD3 253 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 DOLPP1Q86YN1 238 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 PHF12Q96QT6 1004 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 PANX1Q96RD7 426 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SPRR3Q9UBC9 169 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TINAGQ9UJW2 476 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 FBXL2Q9UKC9 423 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.31■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JND7 137 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 HCN1O60741 890 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SOX30O94993 753 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 NGFRP08138 427 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 KRT16P08779 473 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TBXA2RP21731 343 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 GDF1P27539 372 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 PTGS2P35354 604 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 LRRC74AQ0VAA2 488 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 RCAN2Q14206 197 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 DCST2Q5T1A1 773 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 FADS6Q8N9I5 356 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 FAM57AQ8TBR7 257 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 GTF2H4Q92759 462 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SLC35G5Q96KT7 338 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A15Q9H2J7 730 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 OR51I1Q9H343 314 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa20.3■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 AQP7O14520 342 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 DYNC1I1O14576 645 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SCO2O43819 266 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 CBR3O75828 277 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 LDLRP01130 860 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 LCN1P31025 176 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 MVDP53602 400 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 EIPR1Q53HC9 387 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SDF2Q99470 211 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 CCDC167Q9P0B6 97 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 B4GALT7Q9UBV7 327 aa20.29■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ALG1L2C9J202 215 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB9F8W1W9 429 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms