RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsf5Q5ND04 624 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OgnQ62000 298 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr871Q7TRF0 311 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr591Q7TRR7 314 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NarsQ8BP47 559 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8C3I9 435 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oard1Q8R5F3 152 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chchd4Q8VEA4 139 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr380Q8VGT3 311 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fitm1Q91V79 292 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssr2Q9CPW5 183 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ift43Q9DA69 206 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plag1Q9QYE0 499 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd300ld4A2A7W1 245 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SrsxB2RZI1 361 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr36E9PV26 1098 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r56E9Q4U5 779 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phox2bO35690 314 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 S100a6P14069 89 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v1e1P50518 226 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CrhbpQ60571 322 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp3r2Q63811 179 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WdcpQ6NV72 663 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mief1Q8BGV8 463 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf592Q8BHZ4 1262 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cxcl16Q8BSU2 246 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs8Q8BXT1 180 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lats1Q8BYR2 1129 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yipf4Q8C407 246 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D2hgdhQ8CIM3 535 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fmo2Q8K2I3 535 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r219Q8R271 312 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhdc8aQ91XA8 350 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufs4Q9CXZ1 175 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LhppQ9D7I5 270 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cib4Q9D9N5 185 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clca3a2Q9EQR4 902 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmrt1Q9QZ59 374 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Khdrbs2Q9WU01 349 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itgb6Q9Z0T9 787 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtprsB0V2N1 1907 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r90A0A087WR36 309 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgl2A9XX86 381 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Catsperg1E9Q355 1151 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r102L7N279 857 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mpzl2O70255 215 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zp3P10761 424 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htr3aP23979 487 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcadmP45952 421 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr1cP52432 346 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina7P61939 418 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adra1aP97718 466 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arntl2Q2VPD4 579 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5113Q3UGK8 141 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Szrd1Q6NXN1 152 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp184Q7TSH9 737 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl15Q8BGR6 204 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acp6Q8BP40 418 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a22Q8R0S9 554 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx11Q91WL6 271 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nkd1Q99MH6 471 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sema6cQ9WTM3 931 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lhx9Q9WUH2 397 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spag17Q5S003 2320 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr59B1ARL3 323 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CrnnD3YUU6 520 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam46aD3Z5S8 447 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr544E9PX47 334 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8926L7MUE8 181 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MgllO35678 303 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UoxP25688 303 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxc5P32043 222 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fmo1P50285 532 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alox12eP55249 662 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr143P70259 405 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VaspP70460 375 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Coq7P97478 217 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dtx3lQ3UIR3 748 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifngr2Q63953 332 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbccd1Q640P7 552 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tm7sf2Q71KT5 418 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r13Q7M720 305 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Otub1Q7TQI3 271 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap4e1Q80V94 1122 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubash3bQ8BGG7 638 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EloaQ8CB77 773 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr1d1Q8VCX1 325 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr166Q8VGX2 312 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Use1Q9CQ56 270 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mospd2Q9CWP6 518 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl8a6Q9DAY2 240 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpar3Q9EQ31 354 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adat1Q9JHI2 499 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scgb2b17S4R2V3 82 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3952A0A0A6YXJ1 191 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A286YCH8 300 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 3110040M04RikA0A286YDK0 300 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A286YE43 300 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex264E9Q137 309 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.7 ms