RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	NANS	Q9NR45	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DSCAM	O60469	2012 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR7A17	O14581	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TPST1	O60507	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TFPI	P10646	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CPN1	P15169	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GM2A	P17900	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DRD4	P21917	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CHM	P24386	653 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZXDA	P98168	799 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NR6A1	Q15406	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LCTL	Q6UWM7	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	AQP7	O14520	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC31A1	O15431	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TPST2	O60704	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RECK	O95980	971 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NR2F1	P10589	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HGF	P14210	728 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CD46	P15529	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MATN1	P21941	496 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DCK	P27707	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SPINT3	P49223	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FRZB	Q92765	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	UBD	O15205	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CHRNE	Q04844	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RCAN2	Q14206	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NPTX1	Q15818	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DECR1	Q16698	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RHBG	Q9H310	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751		A0A0J9YY10	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751		K7ERQ8	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MFSD11	O43934	449 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SCO1	O75880	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HLA-E	P13747	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FGFR4	P22455	802 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GJA4	P35212	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CAPG	P40121	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DNAJB13	P59910	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FADD	Q13158	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TTC9	Q92623	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DYRK2	Q92630	601 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms