RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SERPINA11Q86U17 422 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 IFNEQ86WN2 208 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM156Q8N614 296 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SLC15A4Q8N697 577 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 RNF148Q8N7C7 305 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 BCORP1Q8N888 145 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ANKFN1Q8N957 763 aa7.85□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 EXTL1Q92935 676 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 MAL2Q969L2 176 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 ALG2Q9H553 416 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 A4GALTQ9NPC4 353 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.85□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.85□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.84□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 H6PDO95479 791 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 IL33O95760 270 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 WDPCPO95876 746 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1D-16P01601 117 aa7.84□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 CHRM4P08173 479 aa7.84□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 FBXO45P0C2W1 286 aa7.84□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 BMP2P12643 396 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V1C1P21283 382 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CASRP41180 1078 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 GSK3BP49841 420 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 GZMMP51124 257 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CRISP3P54108 245 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 SCARB2Q14108 478 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 GNA13Q14344 377 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ADRM1Q16186 407 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ZSCAN26Q16670 478 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 LYPD8Q6UX82 237 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 PTOV1Q86YD1 416 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 FAM13CQ8NE31 585 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 OR2T12Q8NG77 320 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 FAM110BQ8TC76 370 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 DIO2Q92813 273 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF583Q96ND8 569 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 COL21A1Q96P44 957 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SDF2Q99470 211 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 THTPAQ9BU02 230 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 HPF1Q9NWY4 346 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 LIPT1Q9Y234 373 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.84□□□□□ -1.15
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