RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592253.5

ITGA2B-208, Transcript of integrin subunit alpha 2b, human

TSL 4

Gene ITGA2B, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA2B-208	ENST00000592253	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253		A0A1B0GTH9	108 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	FAM234B	A2RU67	622 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	RFXANK	O14593	260 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SCN2B	O60939	215 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	KCNK2	O95069	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	AGFG2	O95081	481 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ANP32D	O95626	131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	CELA3A	P09093	270 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	MATN1	P21941	496 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	UQCRC2	P22695	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	PTGDS	P41222	190 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	MAP3K8	P41279	467 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	CASP9	P55211	416 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	CASP6	P55212	293 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SQLE	Q14534	574 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	GNRHR2	Q96P88	292 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	OR7D2	Q96RA2	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	STAC	Q99469	402 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	INPP5K	Q9BT40	448 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	BTBD2	Q9BX70	525 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	PIGU	Q9H490	435 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	RMND5A	Q9H871	391 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	CCDC154	A6NI56	674 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	NR5A2	O00482	541 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SNPH	O15079	494 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SLC19A2	O60779	497 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRAPPC6A	O75865	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	UTS2	O95399	124 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	IGKV1D-16	P01601	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	GSN	P06396	782 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ATP6V1C1	P21283	382 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	CDKN2C	P42773	168 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ATP4B	P51164	291 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	STX5	Q13190	355 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	DCST2	Q5T1A1	773 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	STON2	Q8WXE9	905 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	VPS33A	Q96AX1	596 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ITCH	Q96J02	903 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	GIN1	Q9NXP7	522 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	PRRG2	O14669	202 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	SOX30	O94993	753 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TPO	P07202	933 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	HPGD	P15428	266 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	PTGS2	P35354	604 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRPC1	P48995	793 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	MAN2A2	P49641	1150 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	KHK	P50053	298 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ITGA2B-208	ENST00000592253	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63

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