RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SLC9A6	Q92581	669 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SDHD	O14521	159 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	KLF11	O14901	512 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CFLAR	O15519	480 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CBR3	O75828	277 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	C6orf47	O95873	294 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ALOX5	P09917	674 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	KIT	P10721	976 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ACP2	P11117	423 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ACVR2A	P27037	513 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	EVI2B	P34910	448 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	MAP3K8	P41279	467 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	TTMP	Q5BVD1	217 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	OGFOD2	Q6N063	350 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	FBXO30	Q8TB52	745 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PIK3R3	Q92569	461 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SERHL	Q9NQF3	203 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	WDR1	O75083	606 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	COL8A1	P27658	744 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	EIPR1	Q53HC9	387 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SFXN5	Q8TD22	340 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	JADE3	Q92613	823 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SH3GL2	Q99962	352 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PRSS44	E7EML9	344 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SCO2	O43819	266 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	EPHA3	P29320	983 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GCK	P35557	465 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GAS1	P54826	345 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	TP53BP2	Q13625	1128 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	DUSP5	Q16690	384 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ACAD11	Q709F0	780 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	RPRML	Q8N4K4	120 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	MOAP1	Q96BY2	351 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	FADS1	O60427	444 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	UTS2	O95399	124 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	IGKV1D-16	P01601	117 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	KRT16	P08779	473 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GABRA1	P14867	456 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SOAT1	P35610	550 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	KIR3DL1	P43629	444 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	HBA1	P69905	142 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	COX18	Q8N8Q8	333 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		18.27	■□□□□ 0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms