RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 DPM1O60762 260 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 IGKV1D-16P01601 117 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 IST1P53990 364 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNC4Q03721 635 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 C3orf38Q5JPI3 329 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM69BQ5VUD6 431 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZAR1Q86SH2 424 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 VRK2Q86Y07 508 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF619Q8N2I2 560 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 WFDC6Q9BQY6 131 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CHST2Q9Y4C5 530 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 AGAP5A6NIR3 686 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 SAGE2PA6NJ88 616 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PDLIM1O00151 329 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PIGAP37287 484 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PPICP45877 212 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 AQP4P55087 323 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 EBPQ15125 230 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 NNATQ16517 81 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF311Q5JNZ3 666 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP4R4Q6NUP7 873 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 C9orf40Q8IXQ3 194 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 OR4D11Q8NGI4 311 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 OR52P1PQ8NH57 321 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ADIPOR1Q96A54 375 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 C9orf16Q9BUW7 83 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXJ2Q9P0K8 574 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNE5Q9UJ90 142 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM186AA6NE01 2351 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 NINQ8N4C6 2090 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 LGI1O95970 557 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 UMODP07911 640 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR68Q15743 365 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CBR4Q8N4T8 237 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 AMER2Q8N7J2 671 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC9Q8WXX5 260 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PMM1Q92871 262 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 SEMA4CQ9C0C4 833 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 COPS7AQ9UBW8 275 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 C15orf41Q9Y2V0 281 aa24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 SDK2Q58EX2 2172 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 GNGT2O14610 69 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 IFNW1P05000 195 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF23P17027 643 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PRKAR1BP31321 381 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 MAPK14Q16539 360 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CARM1Q86X55 608 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 B3GNT7Q8NFL0 401 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PADI1Q9ULC6 663 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CBLCQ9ULV8 474 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 IFT52Q9Y366 437 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ENPP4Q9Y6X5 453 aa24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 SYT5O00445 386 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 SEMA7AO75326 666 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ITGA2P17301 1181 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 TBPL2Q6SJ96 375 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 LACC1Q8IV20 430 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PEX5LQ8IYB4 626 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 GALNT4Q8N4A0 578 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 APCDD1LQ8NCL9 501 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 OR2Y1Q8NGV0 311 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF347Q96SE7 839 aa24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 OR6C76A6NM76 312 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 PEX12O00623 359 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RASAL1O95294 804 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 THBS1P07996 1170 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 DRD5P21918 477 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 DCTP40126 519 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM164Q5U3C3 297 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 PACRGLQ8N7B6 248 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 BCORP1Q8N888 145 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 C8orf44Q96CB5 159 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 OR10H1Q9Y4A9 318 aa24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 FRG2CA6NGY1 282 aa24.07■■□□□ 1.44
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