RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 C6orf47O95873 294 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 KLK1P06870 262 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 IL3P08700 152 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 HTR1AP08908 422 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ALPPL2P10696 532 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OSMP13725 252 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 HTR1BP28222 390 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SOAT1P35610 550 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SOX11P35716 441 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TRIM23P36406 574 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CCR5P51681 352 aa7.54□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 BMXP51813 675 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PER3P56645 1201 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 IL1RL1Q01638 556 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 RHAGQ02094 409 aa7.54□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DCST1Q5T197 706 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CASP12Q6UXS9 341 aa7.54□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 IQCHQ86VS3 1027 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LGALS12Q96DT0 336 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.54□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.54□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.54□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.54□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.53□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 IGLON5A6NGN9 336 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZAR1LA6NP61 321 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 AIREO43918 545 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SULT1C4O75897 302 aa7.53□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 ETHE1O95571 254 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PTTG1O95997 202 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TGFB1P01137 390 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 CCL4P13236 92 aa7.53□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 CD36P16671 472 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CBLP22681 906 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PDHA2P29803 388 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CMPK1P30085 196 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 MPIP34949 423 aa7.53□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 PSMD7P51665 324 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PPP5CP53041 499 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CDH12P55289 794 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SKP1P63208 163 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ADAM8P78325 824 aa7.53□□□□□ -1.2
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GGA3-218ENST00000584243 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 KRT33BQ14525 404 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 NCF4Q15080 339 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TIGD6Q17RP2 521 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF404Q494X3 552 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 KLHL22Q53GT1 634 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 RNF130Q86XS8 419 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.53□□□□□ -1.2
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