RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LIAS	O43766	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PAGE4	O60829	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	VENTX	O95231	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FTH1	P02794	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TUBB	P07437	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DANCR	P0C864	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CYP4B1	P13584	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GABRB1	P18505	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	UGT2B10	P36537	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CD79B	P40259	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FOXF2	Q12947	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GSTA3	Q16772	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	USP51	Q70EK9	711 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ELMO1	Q92556	727 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TSLP	Q969D9	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	REPS1	Q96D71	796 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TIMP4	Q99727	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A1W2PPV9	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CTDSP2	O14595	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	P2RX6	O15547	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KIAA0513	O60268	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KIF5C	O60282	957 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR2J2	O76002	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR6B1	O95007	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234		P04436	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PI3	P19957	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	JAK1	P23458	1154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ACRV1	P26436	265 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PSMB5	P28074	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CMPK1	P30085	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CCKAR	P32238	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GJC1	P36383	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CDKN1A	P38936	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SOX3	P41225	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CAPZA2	P47755	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DNASE1L1	P49184	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FOXL1	Q12952	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RCAN2	Q14206	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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