RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 POGLUT1Q8NBL1 392 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJB8Q8NHS0 232 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM110BQ8TC76 370 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRHL3Q8TE85 626 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 NODALQ96S42 347 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51I1Q9H343 314 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL7AQ9H8H3 244 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPN7Q9Y6W3 813 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF462Q96JM2 2506 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASNA1O43681 348 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 HS6ST1O60243 411 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYABP02511 175 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNJ2P63252 427 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNTA1Q13424 505 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTDC1Q4AE62 458 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF130Q86XS8 419 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOHHQ9BU89 302 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 G6PC3Q9BUM1 346 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PROK2Q9HC23 129 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASF1BQ9NVP2 202 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0G2JMM0 328 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PPB8 328 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PRS3 328 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR3DP1A8MWS1 328 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGR2O95994 175 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP4B1P13584 511 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNASE1L1P49184 302 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 KHKP50053 298 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASP9P55211 416 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPRE2Q15555 327 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FIGNL1Q6PIW4 674 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAR1Q8WVX9 515 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANGPTL4Q9BY76 406 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPT1P8Q9HAU6 139 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNE3Q9Y6H6 103 aa30.37■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC28A2O43868 658 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1D-16P01601 117 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1QCP02747 245 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEA8P43361 318 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TLE1Q04724 770 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 BICRALQ6AI39 1079 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLAMF8Q9P0V8 285 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARMCX1Q9P291 453 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PINLYPA6NC86 204 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICOSLGO75144 302 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX4O95219 450 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCST2Q5T1A1 773 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPP10Q8N608 796 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF138Q8WVD3 245 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCT8L2Q96SF2 557 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXD2Q9NVH0 621 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLRF1Q9NZS2 232 aa30.35■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF25A6NGN4 478 aa30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 AK1P00568 194 aa30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCN1P31025 176 aa30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCNJQ5T5M9 372 aa30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC30A6Q6NXT4 461 aa30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALNT10Q86SR1 603 aa30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 OLAHQ9NV23 265 aa30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHANK1Q9Y566 2161 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM107AO95990 144 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR12D1P0DN82 309 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXO1Q12778 655 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 RETREG3Q86VR2 466 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 XAGE5Q8WWM1 108 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 NTNG2Q96CW9 530 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSBPL11Q9BXB4 747 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCG2Q9UNQ0 655 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa30.33■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLIC1O00299 241 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF24P17028 368 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVI2BP34910 448 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTGDSP41222 190 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 MVDP53602 400 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATAD3BQ5T9A4 648 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 PACS2Q86VP3 889 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52N2Q8NGI0 321 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 NR4A3Q92570 626 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB8BQ92930 207 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO34Q9NWN3 711 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAPAQ9P0L0 249 aa30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms