RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 DESI1Q6ICB0 168 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OGFOD2Q6N063 350 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SIAH3Q8IW03 269 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 COX18Q8N8Q8 333 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR4N2Q8NGD1 307 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NUDT8Q8WV74 236 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 MOAP1Q96BY2 351 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 COQ8BQ96D53 544 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 MARK4Q96L34 752 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 C7orf26Q96N11 449 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NODALQ96S42 347 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 AIG1Q9NVV5 245 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NCKAP5O14513 1909 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 C2orf72A6NCS6 295 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 E9PBE3 544 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 UBDO15205 165 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZNHIT1O43257 154 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SCO2O43819 266 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ICOSLGO75144 302 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 WISP2O76076 250 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 KRT16P08779 473 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 STSP08842 583 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CYP4B1P13584 511 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CD99P14209 185 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 IDO1P14902 403 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 HPGDP15428 266 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GCKP35557 465 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TRPC1P48995 793 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 C21orf58P58505 322 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 STX1BP61266 288 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 UFM1P61960 85 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SNTA1Q13424 505 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GAB1Q13480 694 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 EID3Q8N140 333 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PIK3R3Q92569 461 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 HGDQ93099 445 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TESCQ96BS2 214 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SLC35A4Q96G79 324 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 MAGEB18Q96M61 343 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GNRHR2Q96P88 292 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TINAGQ9UJW2 476 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 C9JVG2 144 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TSPAN2O60636 221 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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