RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568612.5

VPS35-208, Transcript of VPS35, retromer complex component, humanhuman

TSL 5

Gene VPS35, Length 697 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS35-208ENST00000568612 CD1BP29016 333 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 EPHA3P29320 983 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 MPGP29372 298 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 DDTP30046 118 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 FMO3P31513 532 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 CAPZBP47756 277 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 LHX1P48742 406 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 FHITP49789 147 aa3.05□□□□□ -1.92
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VPS35-208ENST00000568612 GABARAPL2P60520 117 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 RAB2AP61019 212 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 RAB5BP61020 215 aa3.05□□□□□ -1.92
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VPS35-208ENST00000568612 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
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VPS35-208ENST00000568612 IL18R1Q13478 541 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 GPM6BQ13491 265 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 TDGQ13569 410 aa3.05□□□□□ -1.92
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VPS35-208ENST00000568612 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.05□□□□□ -1.92
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VPS35-208ENST00000568612 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
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VPS35-208ENST00000568612 INTS14Q96SY0 518 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 CSF3RQ99062 836 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 TEAD3Q99594 435 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 ACBD6Q9BR61 282 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 TRMOQ9BU70 441 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS35-208ENST00000568612 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.05□□□□□ -1.92
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