RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	TINAG	Q9UJW2	476 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	CREBBP	Q92793	2442 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A1W2PQ72	361 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	MARCH11	A6NNE9	402 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639		K7EPI3	171 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	NDUFS4	O43181	175 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	ASNA1	O43681	348 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	TYROBP	O43914	113 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	UGDH	O60701	494 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	COQ9	O75208	318 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	SPAG7	O75391	227 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	CRCP	O75575	148 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	WDR47	O94967	919 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	ZFPL1	O95159	310 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	OTC	P00480	354 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	SP1	P08047	785 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	NPPB	P16860	134 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	IMPDH1	P20839	514 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	GSTM2	P28161	218 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	SERPINB1	P30740	379 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	PRKAR1B	P31321	381 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	GGT5	P36269	586 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	CYB561	P49447	251 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	CCR8	P51685	355 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	CCNG1	P51959	295 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	DNAJB13	P59910	316 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	RAB8A	P61006	207 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	SKP1	P63208	163 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	BTG2	P78543	158 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	HSF1	Q00613	529 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	HERC3	Q15034	1050 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	PDK4	Q16654	411 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	DEFB134	Q4QY38	66 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	LCTL	Q6UWM7	567 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	SNX31	Q8N9S9	440 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	TTL	Q8NG68	377 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	TSLP	Q969D9	159 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	GPR137	Q96N19	417 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	NPAS2	Q99743	824 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	CENPK	Q9BS16	269 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	MMP25	Q9NPA2	562 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	LRRK2	Q5S007	2527 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PSMA4-208	ENST00000558639	URAD	A6NGE7	173 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM114	B3SHH9	223 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	C19orf84	I3L1E1	186 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	UBXN8	O00124	270 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	PRRG2	O14669	202 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	KLK8	O60259	260 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	PDE9A	O76083	593 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	SUPT7L	O94864	414 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	CLDN14	O95500	239 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	FH	P07954	510 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	ALOX12	P18054	663 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	IL10	P22301	178 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	JAK1	P23458	1154 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	PGGT1B	P53609	377 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	PKNOX1	P55347	436 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC26A5	P58743	744 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	RHAG	Q02094	409 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	RGS1	Q08116	209 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	OR4D1	Q15615	310 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PSMA4-208	ENST00000558639	PHKG1	Q16816	387 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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