RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	IL18BP	O95998	194 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PRPS2	P11908	318 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	BCKDHA	P12694	445 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CYP4B1	P13584	511 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CHM	P24386	653 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GRK2	P25098	689 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MAPK1	P28482	360 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GCK	P35557	465 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PEX19	P40855	299 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DECR1	Q16698	335 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SMU1	Q2TAY7	513 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	KRT71	Q3SY84	523 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CROCCP2	Q86T23	111 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	NATD1	Q8N6N6	113 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TSSK3	Q96PN8	268 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	HHATL	Q9HCP6	504 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CBLC	Q9ULV8	474 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DOCK7	Q96N67	2140 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137		B4DXG7	233 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TM9SF1	O15321	606 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	IL2RA	P01589	272 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	NGFR	P08138	427 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LCN1	P31025	176 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EVI2B	P34910	448 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SERPINB4	P48594	390 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	C21orf58	P58505	322 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DCST1	Q5T197	706 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	NAXE	Q8NCW5	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FAM110B	Q8TC76	370 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	COQ8B	Q96D53	544 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GIMAP5	Q96F15	307 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PGM2	Q96G03	612 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	C3orf30	Q96M34	536 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GIN1	Q9NXP7	522 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ASIC5	Q9NY37	505 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ESPN	B1AK53	854 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DVL2	O14641	736 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EMC8	O43402	210 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	AKAP10	O43572	662 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PEX11A	O75192	247 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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