RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	ACP2	P11117	423 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	PRPS2	P11908	318 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	PRF1	P14222	555 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	GABRA3	P34903	492 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	EVI2B	P34910	448 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ADH7	P40394	386 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	EMX2	Q04743	252 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	HHAT	Q5VTY9	493 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	NUP43	Q8NFH3	380 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	MGARP	Q8TDB4	240 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	RND1	Q92730	232 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	COQ8B	Q96D53	544 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	TIMP4	Q99727	224 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996		Q9N2J8	555 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ASIC5	Q9NY37	505 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	WDR1	O75083	606 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	BMP7	P18075	431 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	KIR3DL1	P43629	444 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	PRKAG1	P54619	331 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	DIO3	P55073	304 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CASP8	Q14790	479 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	MLC1	Q15049	377 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	TOMM20	Q15388	145 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CPTP	Q5TA50	214 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	VASN	Q6EMK4	673 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	MARVELD3	Q96A59	401 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	NUF2	Q9BZD4	464 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PRB8	838 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	EMC8	O43402	210 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SCO2	O43819	266 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	NKX2-2	O95096	273 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	PRPS1L1	P21108	318 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	C21orf58	P58505	322 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	DUSP5	Q16690	384 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	DECR1	Q16698	335 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ACAD11	Q709F0	780 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SZRD1	Q7Z422	152 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ZAR1	Q86SH2	424 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	GALNT10	Q86SR1	603 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	UCK2	Q9BZX2	261 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	TACC2	O95359	2948 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996		A0A0G2JNJ9	132 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CBR3	O75828	277 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	C6orf47	O95873	294 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CHRNB4	P30926	498 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	RFX3	P48380	749 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SLC18A1	P54219	525 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	WNT3	P56703	355 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CLDN8	P56748	225 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SMU1	Q2TAY7	513 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	APOOL	Q6UXV4	268 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	GPR151	Q8TDV0	419 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SLC9A6	Q92581	669 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ARL8A	Q96BM9	186 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CHST11	Q9NPF2	352 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996		Q9UFV3	132 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	TTC36	A6NLP5	189 aa		18.97	■□□□□ 0.63

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