RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CLMPQ9H6B4 373 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 AMY2BP19961 511 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GCH1P30793 250 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 MEF2DQ14814 521 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RSU1Q15404 277 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ACTBL2Q562R1 376 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 PKLRP30613 574 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SH3BP2P78314 561 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RIN1Q13671 783 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CDHR4A6H8M9 788 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GPR75O95800 540 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 LRFN5Q96NI6 719 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 INIPQ9NRY2 104 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 LAMB1P07942 1786 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 FEZF1A0PJY2 475 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SLC16A8O95907 504 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 CHMP24386 653 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 TLE3Q04726 772 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 EXT1Q16394 746 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RPE65Q16518 533 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 GPR26Q8NDV2 337 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ARMC5Q96C12 935 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ICKQ9UPZ9 632 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SYT5O00445 386 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CH25HO95992 272 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 F11P03951 625 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GTF2F2P13984 249 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CPMP14384 443 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ARSAP15289 507 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ENTPD1P49961 510 aa8.02□□□□□ -1.12
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