RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 OR2M7Q8NG81 312 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 ZNF675Q8TD23 568 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 SGCZQ96LD1 299 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 PRODH2Q9UF12 536 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 HAO1Q9UJM8 370 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 CFL2Q9Y281 166 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-217ENST00000550044 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.84□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CAPN14A8MX76 684 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 UPK1AO00322 258 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ASNA1O43681 348 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 HS6ST1O60243 411 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PLOD3O60568 738 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PDE9AO76083 593 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PF4P02776 101 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 LAMP1P11279 417 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 DRD5P21918 477 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ABCD3P28288 659 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ADH7P40394 386 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PPICP45877 212 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PRKAG1P54619 331 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 DIO3P55073 304 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 NRG3P56975 720 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CORO7P57737 925 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PDE7AQ13946 482 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 NTRK2Q16620 822 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ELP4Q96EB1 424 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PROK2Q9HC23 129 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 A0A087WV62 115 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 FAM166BA8MTA8 275 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PLOD2O00469 737 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SDHDO14521 159 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TP53I11O14683 189 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 HDAC3O15379 428 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TBX19O60806 448 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 REM1O75628 298 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CLDN14O95500 239 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CT45A8P0DMV1 189 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CT45A9P0DMV2 189 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ZNF24P17028 368 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 LBPP18428 481 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 KLK2P20151 261 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PRPS1L1P21108 318 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 HPCAL1P37235 193 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CDK9P50750 372 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SMSP52788 366 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CLDN8P56748 225 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 DCAF7P61962 342 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PPP2R2AP63151 447 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 KCNJ2P63252 427 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 HSF1Q00613 529 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 OCRLQ01968 901 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PGS1Q32NB8 556 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CPTPQ5TA50 214 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 BICRALQ6AI39 1079 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SZRD1Q7Z422 152 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SIAH3Q8IW03 269 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.82□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
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