RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 LINC01387J3KSC0 135 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 UPK1AO00322 258 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 SCO2O43819 266 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 LINC00032P0C843 101 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PRPS2P11908 318 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PEPDP12955 493 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 HPCAL1P37235 193 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 DIO3P55073 304 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 KRTAP10-9P60411 292 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PSG6Q00889 435 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 HSPB3Q12988 150 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 GAB1Q13480 694 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PCLAFQ15004 111 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 GALNTL6Q49A17 601 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 TRABD2AQ86V40 505 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 MEIOBQ8N635 442 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 BANPQ8N9N5 519 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 FAM222BQ8WU58 562 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 WNT2BQ93097 391 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 MTERF3Q96E29 417 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PPP3R2Q96LZ3 170 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.37■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 AKAP10O43572 662 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 IL33O95760 270 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 FGF4P08620 206 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 GABRA3P34903 492 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 CPA2P48052 419 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PRKAG1P54619 331 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 DLX5P56178 289 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 KIAA0040Q15053 153 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 BCL2A1Q16548 175 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 DCST1Q5T197 706 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 KANK2Q63ZY3 851 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 CDRT4Q8N9R6 151 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 OR4N2Q8NGD1 307 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 GPR151Q8TDV0 419 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 TSSK3Q96PN8 268 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 SFXN3Q9BWM7 321 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 DSN1Q9H410 356 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 EQTNQ9NQ60 294 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 FBXL2Q9UKC9 423 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 MPDZO75970 2070 aa15.36■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 DOCK7Q96N67 2140 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 TBX19O60806 448 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 SPAG7O75391 227 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 RCBTB2O95199 551 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 HPGDP15428 266 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 HK1P19367 917 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 ALDH3A1P30838 453 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 ZNF136P52737 540 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 GFRA1P56159 465 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 WNT3P56703 355 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PRR5P85299 388 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 C17orf67Q0P5P2 114 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 STX5Q13190 355 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 RAET1LQ5VY80 246 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 OR2A2Q6IF42 318 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 NATD1Q8N6N6 113 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 NAXEQ8NCW5 288 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 NUP43Q8NFH3 380 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 EGLN2Q96KS0 407 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PIGQQ9BRB3 760 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 PIGMQ9H3S5 423 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 ATAD3AQ9NVI7 634 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 CCL27Q9Y4X3 112 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 F8P00451 2351 aa15.35■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 FBN2P35556 2912 aa15.34■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 CLCA1A8K7I4 914 aa15.34■□□□□ 0.05
CASP9-211ENST00000546969 UTS2O95399 124 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms