RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 PER3P56645 1201 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SCAND1P57086 179 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PUDPQ08623 228 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ACSM1Q08AH1 577 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 OVGP1Q12889 678 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PDCLQ13371 301 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PEX6Q13608 980 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 TRAM2Q15035 370 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 HFEQ30201 348 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 C9orf64Q5T6V5 341 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 LRRC38Q5VT99 294 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 CDK20Q8IZL9 346 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A45Q8N413 288 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 EXD3Q8N9H8 876 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 OR4C6Q8NH72 309 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 OR6X1Q8NH79 312 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PIK3R3Q92569 461 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 BOD1Q96IK1 185 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 OMDQ99983 421 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 DUSP16Q9BY84 665 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 WWP1Q9H0M0 922 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 GANQ9H2C0 597 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 BRF2Q9HAW0 419 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 USP29Q9HBJ7 922 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 STARD5Q9NSY2 213 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 UBE4BO95155 1302 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 CBY3A6NI87 242 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 LRRN3E7EW58 273 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PSMD3O43242 534 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 VEGFDO43915 354 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SOX30O94993 753 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PRSS23O95084 383 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 UNC5CO95185 931 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 LATS1O95835 1130 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 CLEC3BP05452 202 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 GP1BAP07359 652 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 GIMD1P0DJR0 217 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ETS2P15036 469 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 CYP11B1P15538 503 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 GOT1P17174 413 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 LMO1P25800 156 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PSMB6P28072 239 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PPP2R1BP30154 601 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PIK3CBP42338 1070 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SLC6A9P48067 706 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ENTPD1P49961 510 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 NAGLUP54802 743 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 OR2B6P58173 313 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 GALK2Q01415 458 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 MGAT2Q10469 447 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SLAQ13239 276 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 MAMLD1Q13495 774 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ATP1A4Q13733 1029 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 HNF4GQ14541 408 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 BCL7AQ4VC05 210 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 HACD4Q5VWC8 232 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 RESP18Q5W5W9 173 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 PMF1Q6P1K2 205 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 SNX20Q7Z614 316 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-212ENST00000535535 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms