RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	ADH6	P28332	368 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	STX5	Q13190	355 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	LIPJ	Q5W064	366 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SPC24	Q8NBT2	197 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	VSTM2L	Q96N03	204 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CENPK	Q9BS16	269 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	OR10A4	Q9H209	315 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CFL2	Q9Y281	166 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CXCL13	O43927	109 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SUPT3H	O75486	399 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	LY6H	O94772	140 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PNLIPRP2	P54317	469 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R7	Q15435	360 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SGCB	Q16585	318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	APOOL	Q6UXV4	268 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	BEND4	Q6ZU67	534 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	MARCH3	Q86UD3	253 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PDIK1L	Q8N165	341 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	KAT2A	Q92830	837 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	GPR22	Q99680	433 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	DYSF	O75923	2080 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	GMFG	O60234	142 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PGR	P06401	933 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	COL6A2	P12110	1019 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	AGTR1	P30556	359 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	EVI2B	P34910	448 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	FNTA	P49354	379 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	NUDT6	P53370	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SLC12A2	P55011	1212 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CTBP2	P56545	445 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	IRF9	Q00978	393 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	EFR3A	Q14156	821 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	LGSN	Q5TDP6	509 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	GALNT10	Q86SR1	603 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	NXNL1	Q96CM4	212 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM19	Q9H013	955 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PRODH2	Q9UF12	536 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0J9YW62	118 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-222	ENST00000533557		E7EQL1	145 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-222	ENST00000533557	OR7A17	O14581	309 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-222	ENST00000533557	KERA	O60938	352 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-222	ENST00000533557	SEMA3D	O95025	777 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-222	ENST00000533557	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-222	ENST00000533557	FCGR2A	P12318	317 aa		10.77	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms