RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533235.5

SLC43A3-223, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 5

Gene SLC43A3, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	FADS6	Q8N9I5	356 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	TSSK3	Q96PN8	268 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	AKAP10	O43572	662 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	FADS1	O60427	444 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	NPHS1	O60500	1241 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	TBX19	O60806	448 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	SPAG7	O75391	227 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF708	P17019	499 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	CLDN18	P56856	261 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	SRY	Q05066	204 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	GAB1	Q13480	694 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31	2e-6	■■■□□ 16.9
SLC43A3-223	ENST00000533235	TESK1	Q15569	626 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	NRGN	Q92686	78 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	SFXN2	Q96NB2	322 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235		Q9N2J8	555 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	EQTN	Q9NQ60	294 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SLC43A3-223	ENST00000533235	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	MPDZ	O75970	2070 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	SYT5	O00445	386 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZIC3	O60481	467 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZWINT	O95229	277 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	IL33	O95760	270 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	CHEK2	O96017	543 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	IGKV1D-16	P01601	117 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	FGF4	P08620	206 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	CREB1	P16220	341 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	CTSS	P25774	331 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	DPP4	P27487	766 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	MAP3K8	P41279	467 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	FOXF2	Q12947	444 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	STX5	Q13190	355 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	DECR1	Q16698	335 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	GALNTL6	Q49A17	601 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	XKR7	Q5GH72	579 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	CES4A	Q5XG92	561 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR2M3	Q8NG83	312 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	JKAMP	Q9P055	326 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	HCRTR2	O43614	444 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	CHM	P24386	653 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	GPC1	P35052	558 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	KIR2DL3	P43628	341 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	RFX3	P48380	749 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	DGKQ	P52824	942 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	AAGAB	Q6PD74	315 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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