RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	ANXA5	P08758	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SYT1	P21579	422 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GTF2H1	P32780	548 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ID1	P41134	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CRYBB2	P43320	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLA2G16	P53816	162 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CHRNB3	Q05901	458 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GRB14	Q14449	540 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PTPRR	Q15256	657 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NDN	Q99608	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SP140L	Q9H930	580 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TET3	O43151	1660 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A1B0GTW7	788 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYB561D2	O14569	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MID1	O15344	667 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	INSIG1	O15503	277 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SNAI2	O43623	268 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LDB2	O43679	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR10H3	O60404	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	EPO	P01588	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TFPI	P10646	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CD82	P27701	267 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	EPHX2	P34913	555 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CNR2	P34972	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LCN2	P80188	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PSG6	Q00889	435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GHRHR	Q02643	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RAD51	Q06609	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDC20	Q12834	499 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ABCC11	Q96J66	1382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	OIP5	O43482	229 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MED14	O60244	1454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GMDS	O60547	372 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TPST2	O60704	377 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPANK1	O95872	356 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CTGF	P29279	349 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SRD5A2	P31213	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	UGT1A5	P35504	534 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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