RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 UBQLNLQ8IYU4 475 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CCNYL1Q8N7R7 359 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FADS6Q8N9I5 356 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 MED12LQ86YW9 2145 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 A0A087WV62 115 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CASKO14936 926 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FADS1O60427 444 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 COQ9O75208 318 aa15.29■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 PEPDP12955 493 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FOSL1P15407 271 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 HK1P19367 917 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 STX5Q13190 355 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CYP27C1Q4G0S4 372 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 RAET1LQ5VY80 246 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 TMEM107Q6UX40 140 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 OR2M3Q8NG83 312 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SMPDL3BQ92485 455 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 STARD4Q96DR4 205 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 MED11Q9P086 117 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 NDRG3Q9UGV2 375 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 TBK1Q9UHD2 729 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 ACANP16112 2415 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A20A6NK97 555 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 H0YC42 278 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 MSTNO14793 375 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CD53P19397 219 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CLDN15P56746 228 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FAM27E3Q08E93 113 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLC29A2Q14542 456 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 IMPG1Q17R60 797 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 VWA1Q6PCB0 445 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 MEIOBQ8N635 442 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 MZB1Q8WU39 189 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FIG4Q92562 907 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 GLIPR2Q9H4G4 154 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 DCDC2Q9UHG0 476 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 EMCNQ9ULC0 261 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.28■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 G3V2L1 256 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 UPK1AO00322 258 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLITRK5O94991 958 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CRHP06850 196 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FAM153BP0C7A2 387 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 HOXC12P31275 282 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 DECR1Q16698 335 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FAM153CQ494X1 144 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 OR2A2Q6IF42 318 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 BTLAQ7Z6A9 289 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 IFT20Q8IY31 132 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CCDC126Q96EE4 140 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 PGM2Q96G03 612 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 AMDHD1Q96NU7 426 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 Q9N2J8 555 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 MYNNQ9NPC7 610 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 ABCG2Q9UNQ0 655 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PPM1 405 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SEC14L5O43304 696 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PSMG1O95456 288 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 IL33O95760 270 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 MYL2P10916 166 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 NTSP30990 170 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 RFX3P48380 749 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ZYG11AQ6WRX3 759 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 TRIM46Q7Z4K8 759 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 MARCH3Q86UD3 253 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 OR2L13Q8N349 312 aa15.26■□□□□ 0.03
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