RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AAGABQ6PD74 315 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFNEQ86WN2 208 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDIASQ8IXT1 998 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NAXEQ8NCW5 288 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR6Y1Q8NGX8 325 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP3R2Q96LZ3 170 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSSK3Q96PN8 268 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UCN2Q96RP3 112 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIB1Q96RU8 372 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF559Q9BR84 538 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SH3BP4Q9P0V3 963 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXL2Q9UKC9 423 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLQO75417 2590 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM114B3SHH9 223 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIP5K1BO14986 540 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TYROBPO43914 113 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZIC3O60481 467 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BPGMP07738 259 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCKDHAP12694 445 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BMP5P22003 454 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPK1P28482 360 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EVI2BP34910 448 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPC1P35052 558 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP3K8P41279 467 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLK3P49761 638 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF136P52737 540 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MANFP55145 182 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCL2A1Q16548 175 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GALNTL6Q49A17 601 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS26BQ4G0F5 336 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARSKQ6UWY0 536 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 L3MBTL1Q9Y468 752 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MED12Q93074 2177 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM233B4DJY2 109 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKAP10O43572 662 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNH1O95259 989 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL18BPO95998 194 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CREB1P16220 341 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTSSP25774 331 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPP4P27487 766 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GABRA3P34903 492 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OPRM1P35372 400 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL3P39023 403 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ETV4P43268 484 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASCL1P50553 236 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WNT3P56703 355 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPB3Q12988 150 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MLC1Q15049 377 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF385BQ569K4 471 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XKR7Q5GH72 579 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FADS6Q8N9I5 356 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDRT4Q8N9R6 151 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TM9SF2Q99805 663 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PARD6BQ9BYG5 372 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HHATLQ9HCP6 504 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP6V1HQ9UI12 483 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DKKL1Q9UK85 242 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 B4DXG7 233 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC01387J3KSC0 135 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NKX2-2O95096 273 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RCBTB2O95199 551 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LHX2P50458 406 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYBPHQ13203 477 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GANABQ14697 944 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NATD1Q8N6N6 113 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP43Q8NFH3 380 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLHC1Q8NHS4 586 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WNT2BQ93097 391 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SFXN2Q96NB2 322 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SH3GL2Q99962 352 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DSN1Q9H410 356 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms