RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K8P41279 467 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PNLIPRP2P54317 469 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SNTA1Q13424 505 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 EFR3AQ14156 821 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MFSD12Q6NUT3 480 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 XKRXQ6PP77 449 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ZAR1Q86SH2 424 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP43Q8NFH3 380 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 TMCO6Q96DC7 493 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf58Q96GQ5 468 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 YIPF4Q9BSR8 244 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf36Q9H7Y0 433 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 Q9N2J8 555 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ASIC5Q9NY37 505 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF6Q9Y252 685 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A27PA6NNH2 459 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SNNO75324 88 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf47O95873 294 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 AGAP20933 346 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 GABRA3P34903 492 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ADH7P40394 386 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 EMX2Q04743 252 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PMPCAQ10713 525 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 STX5Q13190 355 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP5Q16690 384 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf185Q5T7R7 199 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 WLSQ5T9L3 541 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CPTPQ5TA50 214 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC16A11Q8NCK7 471 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 TTYH2Q9BSA4 534 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT2B28Q9BY64 529 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ALKBH4Q9NXW9 302 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 NTMQ9P121 344 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX15Q9BXT5 2789 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PRB8 838 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 NKX2-6A6NCS4 301 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SDHDO14521 159 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 FADS1O60427 444 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 NKX2-2O95096 273 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 IL33O95760 270 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 GLI4P10075 376 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PRF1P14222 555 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 BMP7P18075 431 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PSPHP78330 225 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MLC1Q15049 377 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 DECR1Q16698 335 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP27C1Q4G0S4 372 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 TTMPQ5BVD1 217 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SEM1Q6ZVN7 128 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 HOMEZQ8IX15 550 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ULK2Q8IYT8 1036 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CLECL1Q8IZS7 167 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 EID3Q8N140 333 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5AK3PQ8NH89 298 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR151Q8TDV0 419 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9A6Q92581 669 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2B2Q9GZK3 357 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MEAF6Q9HAF1 191 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO34Q9NWN3 711 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX8Q9Y5X2 465 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0G2JNJ9 132 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 EMC8O43402 210 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR1O75083 606 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 KITP10721 976 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPS1L1P21108 318 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL3P39023 403 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 C21orf58P58505 322 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GRAMD1BQ3KR37 738 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNJQ5T5M9 372 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4F3Q6IEY1 312 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 FIGNL1Q6PIW4 674 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 APOOLQ6UXV4 268 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PLCZ1Q86YW0 608 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC4FQ8N1N0 589 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CDRT4Q8N9R6 151 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 JADE3Q92613 823 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MARVELD3Q96A59 401 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 COQ8BQ96D53 544 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMP4Q99727 224 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP26Q9BV47 211 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 UCK2Q9BZX2 261 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 Q9UFV3 132 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 HEATR5AQ86XA9 2040 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 LRBAP50851 2863 aa17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms