RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TMCC2	O75069	709 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SUPT3H	O75486	399 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CT62	P0C5K7	136 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TBXA2R	P21731	343 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	GPX3	P22352	226 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SRD5A2	P31213	254 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CCKAR	P32238	428 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	IDUA	P35475	653 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FNTA	P49354	379 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PCYT1A	P49585	367 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	LHX2	P50458	406 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	NEK2	P51955	445 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	GFRA1	P56159	465 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	POU4F1	Q01851	419 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	OCRL	Q01968	901 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FUT7	Q11130	342 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SNTA1	Q13424	505 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FGFBP1	Q14512	234 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT13	Q86X67	352 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CAVIN3	Q969G5	261 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	REPS1	Q96D71	796 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TMCO6	Q96DC7	493 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PBK	Q96KB5	322 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	DIRC2	Q96SL1	478 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ITPA	Q9BY32	194 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	REG4	Q9BYZ8	158 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FREM3	P0C091	2139 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PS29	197 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EPI3	171 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	HS3ST1	O14792	307 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	HCRTR2	O43614	444 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS11D	O60235	418 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PSPN	O60542	156 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT2B11	O75310	529 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	EED	O75530	441 aa	Known RBP	9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	REM1	O75628	298 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	GBA	P04062	536 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CD1D	P15813	335 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PAX1	P15863	534 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF708	P17019	499 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	EPOR	P19235	508 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	DPP4	P27487	766 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT20	P35900	424 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3CB	P42338	1070 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	XK	P51811	444 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN18	P56856	261 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4D1	Q15615	310 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ETFDH	Q16134	617 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP1B1	Q16678	543 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF611	Q8N823	705 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PDPR	Q8NCN5	879 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FIG4	Q92562	907 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	HGD	Q93099	445 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCF	Q9NPI8	374 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB4	Q9Y574	426 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	USF3	Q68DE3	2245 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	DSCAM	O60469	2012 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	MED12	Q93074	2177 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0A6YYD5	115 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PGRMC2	O15173	223 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOX3	O15254	700 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC14L5	O43304	696 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	EMC8	O43402	210 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CD5L	O43866	347 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	NAT2	P11245	290 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PEPD	P12955	493 aa		9.74	□□□□□ -0.85

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