RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	STMN1	P16949	149 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGHV1-2	P23083	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	NF2	P35240	595 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	DIO3	P55073	304 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	IL18R1	Q13478	541 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	GAMT	Q14353	236 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	OTP	Q5XKR4	325 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPBP1	Q86WP2	473 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	VPS39	Q96JC1	886 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	DEFB118	Q96PH6	123 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPX	Q9BT56	116 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	NLN	Q9BYT8	704 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	WWP2	O00308	870 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	TOX	O94900	526 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	PGK1	P00558	417 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	GNS	P15586	552 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR3A4P	P47883	348 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SGSH	P51688	502 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	CARTPT	Q16568	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF699	Q32M78	642 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	AMZ2	Q86W34	360 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPR65	Q8IYL9	337 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR4F4	Q96R69	305 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SIRPD	Q9H106	197 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBE4B	O95155	1302 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	CFAP73	A6NFT4	308 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR7A17	O14581	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	STK17B	O94768	372 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ALPP	P05187	535 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ALPPL2	P10696	532 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	NR2C1	P13056	603 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SBK1	Q52WX2	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	AGK	Q53H12	422 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	CEND1	Q8N111	149 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	TECTB	Q96PL2	329 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	CARD6	Q9BX69	1037 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ABCG8	Q9H221	673 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	MBD2	Q9UBB5	411 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	USP6	P35125	1406 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	PINLYP	A6NC86	204 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	EMC8	O43402	210 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC4A1	P02730	911 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAGEA4	P43358	317 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	UCN	P55089	124 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	WASHC5	Q12768	1159 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	PDK1	Q15118	436 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB35	Q15286	201 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRR4	Q16378	134 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	IL23R	Q5VWK5	629 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM231B	A6NCW3	169 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SDC3	O75056	442 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	SEC22B	O75396	215 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NCKAP1-208	ENST00000495619	PROS1	P07225	676 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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