RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495129.2

RPL23AP54-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP54, Length 419 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP54-201ENST00000495129 VCLP18206 1134 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 BDNFP23560 247 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 HTR1EP28566 365 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 SERPINB6P35237 376 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 RBMXP38159 391 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 CTRLP40313 264 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 BTDP43251 543 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NSFP46459 744 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 RPS10P46783 165 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 IL9RQ01113 521 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NPRL3Q12980 569 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 CCDC158Q5M9N0 1113 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NKAIN2Q5VXU1 208 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 CLEC4GQ6UXB4 293 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 LINC00696Q6ZRV3 163 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 LINC01551Q86U37 167 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 PARGQ86W56 976 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 ALLCQ8N6M5 410 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 CCDC89Q8N998 374 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NAT8LQ8N9F0 302 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 SUMF2Q8NBJ7 301 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 MDS2Q8NDY4 140 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 OR4F17Q8NGA8 305 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NEIL3Q8TAT5 605 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 HIST1H2ACQ93077 130 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 HAVCR1Q96D42 359 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 OR4F4Q96R69 305 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TSPAN18Q96SJ8 248 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 APOOQ9BUR5 198 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 ABCB8Q9NUT2 735 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 DNAJB9Q9UBS3 223 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NARFQ9UHQ1 456 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 PHF11Q9UIL8 331 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 LIPT1Q9Y234 373 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 GRIN2DO15399 1336 aa0.88□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 LRP4O75096 1905 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 THSD7BQ9C0I4 1608 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 A0A0J9YVX5 310 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 PSMB11A5LHX3 300 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NKX2-6A6NCS4 301 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 FAM166BA8MTA8 275 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 E9PLD3 99 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLC28A1O00337 649 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TM9SF1O15321 606 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 EFNA2O43921 213 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 UFL1O94874 794 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 HSPA4LO95757 839 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 IGHV3-48P01763 117 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 CD55P08174 381 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 IGLL1P15814 213 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TBPP20226 339 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 MAGP20916 626 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 NUDT1P36639 197 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 SGSHP51688 502 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 KCNJ11Q14654 390 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 RAB35Q15286 201 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 GPAT3Q53EU6 434 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 IGFL1Q6UW32 110 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 ARSKQ6UWY0 536 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 PRSS42Q7Z5A4 293 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TMEM61Q8N0U2 210 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 C20orf203Q8NBC4 194 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZBTB44Q8NCP5 570 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 OR2AP1Q8NGE2 309 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 OR9A1PQ8NGU1 263 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TADA1Q96BN2 335 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TMEM80Q96HE8 168 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 FAM210BQ96KR6 192 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 MBOAT4Q96T53 435 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TXN2Q99757 166 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 CD274Q9NZQ7 290 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 SPRR3Q9UBC9 169 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 MAD2L2Q9UI95 211 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 ENTPD4Q9Y227 616 aa0.87□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa0.86□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 A0A0J9YXY3 114 aa0.86□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 I3L1I5 382 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 SDC3O75056 442 aa0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms